Les primeres edificacions de les que es té constància en aquest indret són d’època medieval. Aquest inmoble fou adquirit pels Sanglada al segle XVII, i l’edifici patí una important reforma i reestructuració. El resultat és la casa que podem veure a l’actualitat, d’estètica barroca. Segles més tard, a finals del segle XIX, la família burgesa Blanes va adquirir l’edifici i el 1927 va ser comprada pel músic i mecenes cultural Josep Balaguer. Balaguer fou el darrer propietari de la casa, ja que a la seva mort va fer donació del casal a l’Ajuntament de Palma, amb la condició de que albergués la seu del Cercle de Belles Arts.

L’any 2009, l’Ajuntament de Palma arribà a un acord amb el Cercle de Belles Arts per tal que Can Balaguer passés a gestionar l’immoble i les seves col·leccions, i amb l’objectiu de rehabilitar aquest espai emblemàtic al centre de Palma. És aquest el tret de sortida de la recent rehabilitació realitzada a càrrec dels arquitectes Francesc Pizà, M. José Duch, Ricardo Flores i Eva Prats, que finalitzà l’any 2016. El resultat d’aquesta reforma, que ha estat fidel i respectuosa amb l’entorn i l’edifici original, ha donat lloc a la museïtzació de diferents estances del casal i ha reconvertit l’antic espai privat i domèstic, en un espai cultural i públic, obert a la ciutadania.